Gıda sanayi atık su arıtma işlemi, değişik tekniklerin bir arada kullanılması ile gerçekleştirilir. Bu teknikler arasında membran filtrasyonu, biyolojik oksidasyon, kimyasal çöktürme ve çeşitli fiziksel işlemler yer alır. Amacı, arıtılmış suyu tekrar doğal çevreye bırakmak veya tekrar kullanılabilir hale getirmektir.