العمليات البيولوجية لا تعتمد فقط على العمليات الفيزيائية والكيميائية في معالجة المياه ، بل يمكن أن تعزز كفاءة العمليات الأخرى. تعتمد كفاءة العمليات البيولوجية على نوع وكمية الكائنات الحية الدقيقة الموجودة في الماء ، وكذلك درجة حرارة الماء وقيمة الرقم الهيدروجيني ومستوى الأكسجين. يجب مراقبة كفاءة وفعالية العمليات البيولوجية بشكل مستمر وضبطها عند الحاجة.